用作沼氣發(fā)酵原料的有機(jī)物種類(lèi)繁多，如禽畜糞便、作物秸稈、食品加工廢物和廢水，以及酒精廢料等，其主要化學(xué)成分為多糖、蛋白質(zhì)和脂類(lèi)。

      其中多糖類(lèi)物質(zhì)是發(fā)酵原料的主要成分，它包括淀粉、纖維素、半纖維 素、果膠質(zhì)等。這些復(fù)雜有機(jī)物大多數(shù)在水中不能溶解，必須首先被發(fā)酵細(xì)菌所分泌的胞外酶水解為可溶性糖、肽、氨基酸和脂肪酸后，才能被微生物所吸收利用。發(fā)酵性細(xì)菌將上述可溶性物質(zhì)吸收進(jìn)入細(xì)胞后，經(jīng)過(guò)發(fā)酵作用將它們轉(zhuǎn)化為乙酸、丙酸、丁酸等脂肪酸和醇類(lèi)及一定量的氫、二氧化碳。在沼氣發(fā)酵測(cè)定過(guò)程中，發(fā)酵液中的乙酸、丙酸、丁酸總量稱(chēng)為中揮發(fā)酸（TVA）。蛋白質(zhì)類(lèi)物質(zhì)被發(fā)酵性細(xì)菌分解為氨基酸，又可被細(xì)菌合成細(xì)胞物質(zhì)而加以利用，多余時(shí)也可以進(jìn)一步被分解生成脂肪酸、氨和硫化氫等。蛋白質(zhì)含量的多少，直接影響沼氣中氨及硫化氫的含量，而氨基酸分解時(shí)所生成的有機(jī)酸類(lèi)，則可繼續(xù)轉(zhuǎn)化而生成甲烷、二氧化碳和水。脂類(lèi)物質(zhì)在細(xì)菌脂肪酶的作用下，首先水解生成甘油和脂肪酸，甘油可進(jìn)一步按糖代謝途徑被分解，脂肪酸則進(jìn)一步被微生物分解為多個(gè)乙酸。