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威尼德方波與指數波電穿孔儀:電轉化實驗過程中操作細節(jié)與注意事項

閱讀:17發(fā)布時間:2026-5-23

 

一、制備感受態(tài)的菌液收集時間:

1、準確測定OD值:OD在1.2~1.5之間。

1) 為了準確測定OD值,建議將菌液稀釋不同濃度測定(1、2、4、8、16倍稀釋,看其OD值是否呈線性關系)。每個倍數做3-5個重復,應該可以大致推斷OD值是否準確!菌液看上去渾濁,但OD值不高,很可能OD稀釋倍數不夠!

2) OD值是否測準也可以這樣估算:OD600為40左右時,菌體濕重(6000rpm離心5min)約0.95g/10ml。高密度發(fā)酵時菌體濕重將相應下降。

(MTT方法即比色法的吸收度在0.2~0.8之間誤差較小。這和分析化學中的lambert-beer定律有關, 對朗伯-比爾定律的偏離在吸光光度分析中,經常出現標準曲線不呈直線的情況,特別是當吸光物質濃度較高時,明顯地看到通過原點向濃度軸彎曲的現象(吸光度軸彎曲)。這種情況稱為偏離朗伯-比爾定律。若在曲線彎曲部分進行定量,將會引起較大的誤差。在吸光光度分析中,儀器測量不準確也是誤差的主要來源。任何光度計都有一定的測量誤差)

2、75ml的菌,經18h左右的培養(yǎng),sorbital洗滌完畢后,50ml離心管里所剩菌體特別濃,需要1ml sorbitol才可溶解為糊狀。正常培養(yǎng)的OD在1.2~1.5之間的500ml菌液,收集的感受態(tài)也用1ml稀釋的,沒那么粘稠??梢钥纯唇档团囵B(yǎng)溫度(27攝氏度)或縮短培養(yǎng)時間(12h)。

3、甚至不用轉接,直接挑單克隆在50-100mlYPD中搖過夜,效果也很好

二、制備感受態(tài)的菌液量

如果只轉一個樣品,50ml就夠了,一般50ml的培養(yǎng)液如果OD值正常的話夠做10管感受態(tài)的,其他的按比例縮小。用大試管搖5ml菌液,然后取1ml毫升在1.5mlEP管中制感受態(tài),每一步的離心時間30秒就行。整個流程時間短,制備好的感受態(tài)用來做轉化的效率很高。

離心,洗滌的過程之后的重懸的時候注意濃度,不要過于粘稠和稀釋。

三、感受態(tài)的保存

感受態(tài)細胞做好后由于電轉化杯還沒有處理好等原因,在冰上放幾個小時再做可能有一定的影響,盡量馬上制備馬上轉化。如果感受態(tài)細胞要保存,不需要加甘油,一般80ul EP管分裝,-70 或 -80 攝氏度保存。

另附:酵母GS115分離純化

接種GS115于5ml YPD液體培養(yǎng)基,30℃,200rpm振蕩過夜,涂布 YPD平板,30℃培養(yǎng)48 小時,用 YNB基本培養(yǎng)基和含His的補充培養(yǎng)基作點種分離純化,挑選在補充培養(yǎng)基生上生長而在基本培養(yǎng)基上不生長的單菌落劃YPD平板,4℃保存。

四、電轉化注意點:

1、感受態(tài)做好后,一次吸出sorbital時,不是直接倒調的,而是用毛細管輕吸出來的,這樣可能使剩下的感受態(tài)純凈些。

2、用毛細管取出100ul出來,加入質粒,混勻?。ㄅ铝坎粔?,吸得很多,電轉時效果反而不好)

3、電轉杯清潔處理:一般先沖洗,洗凈;然后浸泡在75%的乙醇中;使用前我們都是放在超凈臺上,開啟紫外,邊吹風晾干,邊進行紫外照射。電轉杯的新包裝或重復使用可能對轉化率有一定的影響。

4、電擊的時候,電壓數以及電擊時間可以摸索一下,適當增加電壓或者延長電擊時間都可以。電擊條件比如1.5kv,放電4.8~5.5ms。電擊所有過程都要盡量在冰上進行,電擊時間可以減少一點,設置為5ms左右,電擊之后馬上加入預冷的溶液,轉移至EP管,30度靜止培養(yǎng)1h。如果菌體懸液濃度比較大的時候,在制備感受態(tài)的時候要留心一下操作中的問題了。

5、電擊之后,加入1ml的,吸入1.5ml的ep管中,置于30度搖床低速培養(yǎng)1h,再涂板。威尼德生物科技(北京)有限公司(),研發(fā)生產的雙波型電穿孔儀Gene Pulser X2通過高強度的電場作用,瞬時提高細胞膜的通透性,從而吸收周圍介質中的外源分子。這種技術將核苷酸、DNA與RNA、蛋白、糖類、染料以及病毒顆粒等導入原核和真核細胞內。電轉化相對于其它物理和化學轉化方法,是一種有價值和有效的替代方法。廣泛用于植物、動物和微生物的各類細胞電穿孔。


6、注意的是處理液中的DTT是在使用前加入,其它配好后于4度保存,DTT單獨于-20度保存,可配成100倍的貯備液。

7、轉化后1ml用sorbitol重懸的細胞懸液不能全部涂在一塊板子上,按標準程序制作的感受態(tài)一般3塊左右可能比較合適,以干燥后看見一薄層淡淡的白色為宜。轉化子會在白色的薄層上長出圓韻、飽滿的大菌落的。

五、轉化試劑和培養(yǎng)基的正確準備方法

1、MD板子提前幾天做好,放在冰箱里,涂板的時候吸收效果會好些。如果是新板子,可能吸收不是太好,板子上有些積層,反而不利于生長。

2、YNB 42度水浴一會,然后過濾除菌,YNB是加到培養(yǎng)基里面的,去離子水pH偏低,建議直接用蒸餾水就可以(關系不是太大)。

3、,以及無菌去離子水均是冰凍,存放在4度冰箱中

4、一般用10ug以上質粒用SalI酶切,然后直接加乙醇沉淀,70%乙醇洗一遍,約20ul ddH2O重溶。轉化效率一般大于100個克隆每ugDNA。有人用LiCl和DTT處理細胞,轉化效率很高,可以試試。建議你不要用膠回收kit,回收的DNA可能還有鹽,導致電擊時放電時間很短。

5個電轉化方案

方法一:

1.收集菌體

取1mlGS115過夜培養(yǎng)物(OD約6-10) 分裝到1.5ml EP管中,4℃、10000g 離心1min,棄上清,沉淀用無菌水(4℃)洗滌,同樣條件下離心,棄上清。

2.菌體處理

加入1ml處理液,室溫下放置20min。

處理液:

10mM LiAc

10mM DTT(二硫蘇糖醇,常用還原劑,有抗氧化作用)

0.6M sorbitol

10mM TrisHCl(pH7.5)

3.離心,棄上清,加入1ml 1M sorbitol ,離心,棄上清,

4.用1M sorbitol洗滌二次,到體積約為80μl.(菌體太多可適當棄去部分)

5.加入10μl.經過BglⅡ酶切處理的工程質粒,混勻后轉入 電擊杯中,冰浴5min.

6.電轉. 1.5kv,25μF,200Ω條件下進行電轉。

7.電擊后立刻加入1mL 1M sorbitol,吸出后于30℃培養(yǎng)2h。

8.取一定量涂平板(YPDS + Zeocin,涂布的量分別為100、200微升,剩余的經離心處理后全部涂在一個平板上)

有一點要注意的是處理液中的DTT是在使用前加入,其它配好后于4度保存,DTT單獨于-20度保存,可配成100倍的貯備液。

方法二:按下面步驟轉化,開始每個板子只長了一二十菌落;小細節(jié)修改后,每個板長了約100個.

步驟如下:

1、目的DNA(pPIC9K),經電泳檢測已經線性化(SalI酶切);

2、DNA純化方法是經酚仿-氯仿兩步抽提后,無水乙醇沉淀的,目測定量應足夠;

3、GS115甘油菌經新鮮平板復蘇后,5ML培養(yǎng)過夜,16h左右后,取菌1:100稀釋,接種于70ml菌液擴大培養(yǎng),14h后測得OD600約1.3左右。

4、將sorbital、水和菌液均冰??;

5、菌液離心5min-100ml冰水洗滌-50ml冰水洗滌-4ml sorbital洗滌,然后溶解于300ul冰sorbital;

6、加入約5~10ug的DNA,槍吹勻,置0.2CM電轉杯靜置5min;

7、電擊,1,5KV.

8、立即加入1ml冰浴的sorbital,靜止10min。威尼德生物科技(北京)有限公司(),研發(fā)生產的雙波型電穿孔儀Gene Pulser X2通過高強度的電場作用,瞬時提高細胞膜的通透性,從而吸收周圍介質中的外源分子。這種技術將核苷酸、DNA與RNA、蛋白、糖類、染料以及病毒顆粒等導入原核和真核細胞內。電轉化相對于其它物理和化學轉化方法,是一種有價值和有效的替代方法。廣泛用于植物、動物和微生物的各類細胞電穿孔。


9、取100ul轉化液,涂布10cm的MD平板。

做了一點修改每塊板子大概能長100來個菌落(一般需要2天左右):

1、菌液收集時間:以前可能是OD值測得不太準確,我然后把菌液分別做了1、2、4、8、16倍稀釋,看其OD值是否呈線性關系。1、菌液測OD值時,建議將菌液稀釋不同濃度測定,這樣才準確些。菌液看上去渾濁,但OD值不高,很可能就是你的OD稀釋倍數不夠!你分別稀釋2倍、4倍、8倍、10倍等,每個倍數做3-5個重復,應該可以大致推斷OD值是否準確!

2、我開始是先挑單克隆于5mlYPD中,過夜16h后,轉接于50ml YPD中,培養(yǎng)大概18個小時吧。OD值是否測準可以這樣估算:OD600為40左右時,菌體濕重(6000rpm離心5min)約0.95g/10ml。高密度發(fā)酵時菌體濕重將相應下降。

3、電擊條件等上面帖子上都有,1.5kv,放電4.8~5.5ms。

2、其它做法相同,就是感受態(tài)做好后,一次吸出sorbital時,不是直接倒調的,而是用毛細管輕吸出來的,這樣可能使剩下的感受態(tài)純凈些。

3、用毛細管取出100ul出來,加入質粒,混勻?。ㄎ乙郧芭铝坎粔?,吸得很多,電轉時效果反而不好。 )

4、MD板子提前幾天做好,放在冰箱里,涂板的時候吸收效果會好些。如果是新板子,可能吸收不是太好,板子上有些積層,反而不利于生長。

5、你說的YNB,我用的是成品,只需要直接配制。42度水浴一會,然后過濾除菌。我沒有加硫酸銨。YNB是加到培養(yǎng)基里面的,去離子水pH偏低哦,我建議直接用蒸餾水就可以了(關系不是太大)。

方法三:簡便獨特

在篩選高表達菌種中,與大多數人和說明書有區(qū)別(成功做出幾個基因):

每次轉化前,均用多種酶BlgII/salI/sacI同時切,轉化時,用GS115/KM71/KM71H同時轉化,轉化的條件也和大家一樣,即1.5/25/200,但是我用的是0.1的杯子,不是0.2的,轉化后涂MM及YPD+0.25G,長出菌落后,即進行大規(guī)模的表達試驗,直接用YPD表達的,一般48h后即進行大量的SDS-PAGE鑒定,鑒定時,樣品不用濃縮,直接上樣,看到目的帶后再做PCR,測序。

方法四:沒有轉化子(無aa的YNB和硫酸銨稱好后,去離子水溶解,然后高壓滅菌)

1.挑取酵母單菌落,接種至含有50ml YPD培養(yǎng)基的三角瓶中,30℃、250-300rpm培養(yǎng)過夜約14h,OD600約1.3

2.菌液離心5min-50ml冰水洗滌-25ml冰水洗滌-2ml sorbital洗滌,然后溶解于200ul冰sorbital;兩管分裝,每管100ul

3.加入約5~10ug的線性化的DNA20ul,槍吹勻,置0.2CM電轉杯冰浴5min;

4.電擊,1,5KV.使用的是 Eppendorf 2510,用于轉化細菌及酵母。

5.立即加入1ml冰浴的sorbital,靜止1h。

將菌體懸液涂布于MD平板上,每300µl涂布一塊平板;

方法五: 和Invitrogen公司說明書差不多的方法

X33菌株于100ml YPD搖到OD600約1.1-1.3,太高影響感受態(tài)效率

(1) 1500-1700g離心5min,將離心管倒置在吸水紙上輕輕控幾下,充分棄上清

(2) 加入100ml 冰浴的超純水ddH2O,可在振蕩器上振蕩混勻,可靜置3-5分鐘

(3) 離心,棄上清,再加100ml ddH2O洗一遍

(4) 離心,棄上清,加20ml 冰浴1M Sorbitol洗一遍

(5) 離心,棄上清,菌體置于冰浴中,加入約100-200ul Sorbitol混勻

加入Sorbitol量需自己調整,這時菌液很濃,只要能夠用200ul黃槍頭吸出來就可以了,一般共有約400-500ul,夠做幾管感受態(tài)了。

(7) 吸取100-150ul感受態(tài)到線性化的DNA中,用槍頭打勻或手指彈勻

靜置5min,于2mm電轉化杯中,電擊參數:1.5KV,25uF,200歐姆(不是400),一般放電時間在4.5-4.9ms之間,小于4說明你的DNA鹽濃度太高

(9) 立即加入1ml Sorbitol,轉入10ml 離心管,30度靜置1小時,然后加入1ml YPD,30度,200rpm搖1小時,取50-200ul菌液涂100ul/ml YPDS板

(10) 一般轉化效率可以達到:200個以上轉化子每200ul菌液,足夠篩選表達菌株了。

方法六:酵母感受態(tài)細胞的制備威尼德生物科技(北京)有限公司(),研發(fā)生產的雙波型電穿孔儀Gene Pulser X2通過高強度的電場作用,瞬時提高細胞膜的通透性,從而吸收周圍介質中的外源分子。這種技術將核苷酸、DNA與RNA、蛋白、糖類、染料以及病毒顆粒等導入原核和真核細胞內。電轉化相對于其它物理和化學轉化方法,是一種有價值和有效的替代方法。廣泛用于植物、動物和微生物的各類細胞電穿孔。


⑴ 接種Pichia pastoris GS115于5 ml YPD液體培養(yǎng)基,30℃,250~300250 rpm ,過夜。

⑵ 取200µl的培養(yǎng)物接種至含有500ml新鮮培養(yǎng)基的三角搖瓶中,28~30℃、250~300r/min培養(yǎng)過夜,一般12小時左右。

⑶ 將細胞培養(yǎng)物于4℃,5000g離心5min,用500ml的冰預冷的無菌水將菌體沉淀重懸;

⑷ 按步驟3離心,用250ml的冰預冷的無菌水將菌體沉淀重懸;

⑸ 按步驟3離心,用20ml的冰預冷的1M的溶液將菌體沉淀重懸;

⑹ 按步驟3離心,用1ml的冰預冷的1M的溶液將菌體沉淀重懸,其終體積約為2ml;

⑺ NOTE:可將其分裝為200µl一份的包裝冷凍起來,但如果保存時間過長會影響其轉化效率。

化學轉化


畢氏酵母氯化鋰轉化法

試劑

1. 1M LiCl:用去離子蒸餾水配制,濾膜過濾除菌;必要時用消毒去離子水稀釋

2. 50百分子 PEG3350 :Sigma P3640 用去離子蒸餾水配制,濾膜過濾除菌,用較緊的蓋子的瓶子分裝

3. 2mg/ml salmon sperm DNA / TE(10mM Tris-Cl, pH8.0, 1.0mM EDTA)-20℃保存

注:醋酸鋰對畢氏酵母無效,僅氯化鋰有效;PEG3350可屏蔽高濃度LiCl的毒害作用;

畢氏酵母的轉化

1. 煮沸1ml鮭魚精DNA 5min,迅速冰浴以制備單鏈擔體DNA;

2. 將感受態(tài)酵母菌離心,以Tips去除殘余的LiCl溶液;

3. 對于每一個轉化,按以下順序加入:

50%PEG3350 240ul

1M LiCl 36ul

2mg/ml 單鏈Salmon sperm DNA 25ul

5~10ug/50ul H2O 質粒DNA 50ul

4. 劇烈旋渦混勻直至沉淀菌體分布均勻(約1min);

5. 30℃水浴孵育30min;

6. 42℃水浴熱休克20~25min;

7. 6000~8000rpm離心收集酵母菌體;

8. 重懸酵母于1ml YPD培養(yǎng)基,30℃搖床孵育;

9. 1~4h后,取25~100ul菌液鋪選擇性培養(yǎng)基平板,于30℃培養(yǎng)2~3天鑒定(將表達菌株和對照菌株在固體培養(yǎng)基平板,30'c培養(yǎng)至轉化子出現) 

畢氏酵母PEG1000轉化法

試劑

緩沖液A:1.0M Sorbitol,10mM Bicine,pH8.35(sigma),3%(v/v)ethylene glycol

緩沖液B:40%(w/v)PEG1000(sigma),0.2M Bicine,pH8.35

緩沖液C:0.15M NaCl,10mM Bicine,pH8.35

未污染的新鮮、試劑級DMSO,-70℃保存

注:1. 緩沖液A、B、C均用濾膜過濾,-20℃保存;

2. 將DNA直接加在凍結的酵母細胞上是本實驗的關鍵之處(即使在冰上解凍的待轉化細胞,其攝取外源DNA的能力也在解凍過程中迅速下降;如進行多樣品的轉化,建議按6樣品/組進行);

待轉化畢氏酵母的制備

1. 接種環(huán)接種Pachia pastoris于YPD平板,30℃培養(yǎng)2d;

2. 挑取單克隆酵母菌株于10mlYPD培養(yǎng)基中,30℃振蕩培養(yǎng)過夜;

3. 取步驟2中小量菌液接種到100mlYPD培養(yǎng)基中振蕩培養(yǎng),待其OD值從0.1升到0.5~0.8;

4. 室溫下3000g離心收集酵母菌體,50ml緩沖液A洗滌一次;

5. 重懸菌體于4ml緩沖液A中,按0.2ml/管分裝于1.5ml的離心管中,每管加入11ulDMSO,混合后迅速于液氮中冷凍,

6. -70℃保存

畢氏酵母的轉化

1. 將約50ug線性化質粒DNA溶于20ul TE或水中,直接加于凍結的酵母細胞中;加入擔體DNA(40ug變性超聲線性化鮭魚精DNA)以獲得大轉化率;

2. 37℃水浴孵育5min,中間混合樣品1~2次;

3. 取出離心管,加入1.5ml緩沖液B,混勻;

4. 30℃水浴孵育1h;

5. 室溫下2000g離心10min,去除上清液,菌體沉淀重懸于1.5ml緩沖液C中;

6. 離心樣品,去除上清液,輕微操作將樣品重懸于0.2ml緩沖液C中;

7. 將所有轉化液鋪于選擇性平板,于30℃孵育3~4天后,鑒定;威尼德生物科技(北京)有限公司(),研發(fā)生產的雙波型電穿孔儀Gene Pulser X2通過高強度的電場作用,瞬時提高細胞膜的通透性,從而吸收周圍介質中的外源分子。這種技術將核苷酸、DNA與RNA、蛋白、糖類、染料以及病毒顆粒等導入原核和真核細胞內。電轉化相對于其它物理和化學轉化方法,是一種有價值和有效的替代方法。廣泛用于植物、動物和微生物的各類細胞電穿孔。


畢赤酵母轉化方法有4 種 。常用的是電轉化法和原生質體法,其中電轉化法方便,轉化效率高,容易產生多拷貝整合。由于原生質體法須首先制備去除細胞壁的原生質體細胞以利于DNA 進入,然后細胞再生細胞壁,產生轉化體,而ZeocinR 控制細胞壁的形成,導致不能產生轉化體。因此利用ZeocinR 作為選擇標記的載體如p PICZ 系列,不能使用原生質體法進行轉化。



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