鑒于賈第鞭毛蟲和隱孢子蟲它們的孢囊或卵囊在受生活污水污染的地表水、處理不良的自來水中均可檢出。美國自來水協(xié)會對美國1976—1994年間水媒性流行病作了調(diào)查，從數(shù)據(jù)顯示：飲用水中由病原微生物引起的流行疾病，其暴發(fā)率只占24.5%，但致病率卻高達82.5%。其他一些國家也有類似的因供水而引起的病原微生物暴發(fā)?；谫Z第鞭毛蟲致病劑量為10－100個活性孢囊，致病劑量較低，隱孢子蟲致病劑量為1－10個活性卵囊。因“兩蟲"的孢囊和卵囊對人的最小感染劑量非常接近的，假定人飲水量為2.5L/天，以10L水樣為一個采樣單位，其中“兩蟲"的孢囊和卵囊的數(shù)量小于1個即是安全的。在1998年，英國是一個對飲用水中“兩蟲"提出量化標準的國家。隨著我國經(jīng)濟的發(fā)展和水源污染的加劇，以及生活方式的改變，發(fā)達國家遇到的問題很可能也出現(xiàn)在我國，所以應(yīng)引以為戒、未雨綢繆，為了保障飲用水安全，實施優(yōu)質(zhì)供水，上述標準和國家的《城市供水水質(zhì)標準》（CJ/T206-2005）都把這“兩蟲"作為微生物指標來考核，限值均是在10升水中不得檢出1個孢囊或卵囊。

賈第鞭毛蟲和隱孢子蟲二蟲是兩種嚴重危害水質(zhì)安全的、寄生于人和動物體內(nèi)的原生寄生蟲，主要通過飲用水和食品等途徑傳播疾病。由于它們的孢囊和卵囊的表面包裹著一層較厚的囊壁，因此具有非常強的環(huán)境抗性，因為“兩蟲"的孢囊直徑大小只有幾個微米，不易為常規(guī)的沉淀、過濾等處理方法去除，而且孢囊和卵囊對消毒劑的抵抗力遠大于大腸桿菌和脊髓灰質(zhì)炎病毒，對常規(guī)指示菌安全的飲水不能排除原蟲感染的可能性。它們可引起人的消化道感染，癥狀與腹瀉相似。據(jù)相關(guān)報道，自1976年以來，世界各地相繼發(fā)生了“兩蟲"的流行，如1993年美國威斯康星州某市“兩蟲"污染事件導致了約40萬人受到感染，而在我國大部分地區(qū)也多次發(fā)現(xiàn)“兩蟲"病例。

“兩蟲"檢測系統(tǒng)大致分為以下五個步驟，分別是：過濾采樣→ 淘洗濃縮→ IMS 磁分離→ IFA 染色 → 顯微鏡檢，其中過濾采樣僅僅是“兩蟲"檢測環(huán)節(jié)中的一個非核心步驟，實驗方法中所提到的過濾器的型號并不能斷章取義地代表兩蟲檢測的采樣方法實質(zhì)，更不能以偏概全地代表兩蟲檢測全過程的檢測方法；過濾采樣器只是收集樣品的工具，而并非兩蟲檢測的關(guān)鍵技術(shù)，并且隨著兩蟲采樣技術(shù)的進步，只要使用的兩蟲采樣器達到樣本采集的目的即可；如果僅僅用一個過濾采樣器的型號來自稱是國標甚至國際標準的實驗方法，就會混淆了兩蟲檢測方法以及國家標準的本來實質(zhì)。

“兩蟲"檢測系統(tǒng)，采用的是一次性濾囊的過濾采樣方法，且性能指標不僅滿足而且優(yōu)于國標（國標要求濾囊的孔徑為 1μm，我們的孔徑為0.45μm，更小的孔徑，更能保證兩蟲的 99%截留）。