DGiNaSPTM系統(tǒng)工作流程：單細胞分離到NGS分析
流程特點：
· 更低成本：靶向基因檢測，避免看家基因占用的大量測序數(shù)據(jù)，大大節(jié)省了測序和分析成本；
· 罕見轉(zhuǎn)錄本更高檢出率：靶向定制panel，選定特定基因組合，提高UMI計數(shù)效率，罕見轉(zhuǎn)錄本檢測閾值更低；
· 超高細胞捕獲效率：大于60%，遠高于市場上目前所有大通量單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)；
· 克服PCR擴增偏差：引入單細胞測序金標(biāo)準(zhǔn)，分子標(biāo)簽，降低非特異性表達；
· 實現(xiàn)更高的分辨率：可以分辨更精細、微觀的細胞群和細胞亞種群；
· 反轉(zhuǎn)錄的磁珠超長穩(wěn)定存儲：完整cDNA可在磁珠微球結(jié)構(gòu)保存長達16周，隨用隨??；
· 靈活分樣組合：單次實驗，通過的抗體標(biāo)記的方法，既可以提高樣品通量（*多可8個樣本同時建庫，可等分，可隨機組合）；又可以同時進行單細胞蛋白和轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合檢測，大大降低成本的同時，也為單細胞多組學(xué)研究提供了更高效的平臺
靶向設(shè)計
近年來高通量測序平臺的快速發(fā)展引發(fā)了測序成本迅速激進的成本降低，但相對于大量的單細胞轉(zhuǎn)錄組分析需求來說仍是十分昂貴的。我們通過特殊序列設(shè)計的方法，開發(fā)出了多款適用于不同客戶需求的靶向基因檢測試劑盒。具有以下優(yōu)點。
l 更低成本--提高單細胞測序效率，避免看家基因占用的大量測序數(shù)據(jù)，大大節(jié)省了測序和分析成本；
l 罕見轉(zhuǎn)錄本更高檢出率--選定特定基因組合，提高UMI計數(shù)效率，罕見轉(zhuǎn)錄本檢測閾值更低；
l 定制化—提供客戶定制化服務(wù)，專門的設(shè)計軟件和應(yīng)用專家提供專業(yè)的設(shè)計指導(dǎo)和服務(wù)
l 儲存--從樣本中得到的完整 cDNA 可在磁珠上穩(wěn)定存儲，允許將珍貴樣本保存長達 16 周。這可使用戶在時間允許的情況下靈活地對樣本進行測序，并通過對儲存的磁珠池進行等分或分樣來實現(xiàn)同一樣本的多個測定。
l 分樣--在磁珠上儲存的 cDNA可以分成一個或多個等分試樣，并使用定制或預(yù)先設(shè)計的組合（panel）進行擴增。通過提供對部分樣本進行測序的選項和對樣本不同組合（panel）進行測試的靈活性，進一步降低成本。
分子標(biāo)記索引
當(dāng)對序列讀取進行計數(shù)時，PCR 擴增偏差可導(dǎo)致基因定量不準(zhǔn)確。DGiNaSPTM分子標(biāo)簽（UMI）技術(shù)為單個細胞的單個基因分配了的分子索引，也稱為“分子條形碼"。實驗者可借此克服擴增偏差，更準(zhǔn)確地計算轉(zhuǎn)錄水平。
磁珠上分子標(biāo)簽結(jié)構(gòu)。Univ：通用Illumina接頭序列。CL：Cell specific sequence細胞特異序列。大約有88.5萬種細胞標(biāo)記。UMI：Unique molecular index。每個mRNA分子有相同標(biāo)簽。UMIs種類：約6.6萬。Poly-dT：mRNA尾連接。
單分子標(biāo)記流程示意圖
我們?yōu)榭蛻籼峁┒喾N數(shù)據(jù)分析安裝分析軟件和可視化工具，可構(gòu)建自動化的數(shù)據(jù)分析通道。只需對簡單的生物信息學(xué)基本了解即可方便的進行初級分析和二級分析以及數(shù)據(jù)可視化等各種數(shù)據(jù)分析和挖掘，直接生成可用于發(fā)表的結(jié)果和圖片
工作條件：
電壓要求：100-240 Vac, 50-60 Hz, 25 W；
溫度要求：16-28°C；
濕度要求：室溫，不高于85%；
具體參數(shù)
芯片適用樣品類型:一種微流體芯片兼容不同大小及不同類型的真核細胞（貼壁細胞、懸浮細胞、組織、血液等）；
樣本處理通量：反應(yīng)孔數(shù)量達到了22萬個，1-8個通道，單個通道每次可捕獲100-10000單細胞；
自動化：一體化主機設(shè)置，可從細胞分離到建庫完成需要12.5小時，所有步驟均在一個單元完成實現(xiàn)全自動分離建庫，實現(xiàn)快速裂解細胞對基因表達影響*小，**地獲得轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)；
分區(qū)與標(biāo)簽數(shù)：每次運行產(chǎn)生≥9萬個納升級分區(qū)，含有不少于270 萬個的序列標(biāo)簽、**標(biāo)簽或ATAC標(biāo)簽（每個標(biāo)簽由16個堿基構(gòu)成）；
細胞捕獲效率：在樣本細胞群體中捕獲≥60%的單細胞，每 1000 個細胞中含有 雙細胞的比例低于0.9%；
文庫測序儀兼容性：系統(tǒng)提供 Illumina和華大基因兼容測序文庫，建庫樣本滿足 Illumina 和華大基因測序儀要求；
細胞直徑大?。?/b>≤40um；大于40um抽提細胞核檢測試劑盒；
多樣本標(biāo)記: 配套原廠試劑，可以完成細胞樣本及細胞核樣本混樣建庫，細胞樣本混樣單個通道達到10種樣本標(biāo)簽，細胞樣本或細胞核樣本混樣單次實驗可達到80個樣本建庫實驗；
條碼掃描器: 配備2D 條形碼掃描器，掃描試劑信息并跟蹤試劑使用情況；
軟件包括：分析軟件和可視化軟件，免費安裝，免費升級，自帶誤操作提示及更正功能，支持 Wifi，以太網(wǎng)，USB 接口輸出，兼容 LIMS 系統(tǒng)；
目前已有多款經(jīng)驗證的試劑盒可選：
□ 單細胞的基因 3’表達譜測序文庫試劑盒
□ 單細胞的基因5’表達譜測序文庫試劑盒
□Onco-BC 靶向檢測試劑盒（panel）--與乳腺癌和**細胞相關(guān)的 400 個基因檢測
□ **反應(yīng)檢測試劑盒（panel）--**細胞類型譜分析
□ T-細胞靶向檢測試劑盒（panel）--T細胞類型譜分析
□ 單細胞核的ATAC-Seq測序文庫試劑盒
□ 多聚甲醛固定后單細胞轉(zhuǎn)錄組測序文庫試劑盒
□ 客戶自定義檢測試劑盒（panel）--用戶可選擇100-500個靶基因進行檢測，專業(yè)的應(yīng)用工程師將為您的設(shè)計提供技術(shù)支持
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