當(dāng)前位置:上海撫生實業(yè)有限公司>>技術(shù)文章>>如何從ELISA說明書判斷同源蛋白交叉反應(yīng)?
結(jié)合此前長期開展兔ELISA實驗、關(guān)注跨物種檢測預(yù)判、特異性優(yōu)化驗證的相關(guān)背景,通過ELISA試劑盒說明書確認(rèn)同源蛋白交叉反應(yīng)風(fēng)險,不能只簡單查看“交叉反應(yīng)"一欄的文字描述,需要從多個核心維度逐層拆解說明書細(xì)節(jié),全面評估試劑盒的同源蛋白交叉反應(yīng)情況,具體詳細(xì)的排查方法如下:
一、通過「抗體識別表位」描述,預(yù)判同源蛋白交叉反應(yīng)的潛在風(fēng)險
說明書中關(guān)于捕獲抗體、檢測抗體的表位識別區(qū)域描述,是預(yù)判同源蛋白交叉反應(yīng)的核心依據(jù)。如果說明書明確說明,試劑盒配對的2株抗體識別的是靶標(biāo)蛋白的?特異性表位?,且該表位的氨基酸序列在近緣同源蛋白中同源性<30%,那么該試劑盒的同源交叉反應(yīng)風(fēng)險會極低。
反之,如果說明書僅模糊標(biāo)注“識別靶標(biāo)蛋白的全長序列",沒有明確限定表位區(qū)域,就說明抗體識別的是蛋白上的多個廣譜表位,很容易和同源性>60%的近緣同源蛋白發(fā)生非特異性結(jié)合,交叉反應(yīng)風(fēng)險會大幅升高。還可以結(jié)合說明書給出的靶標(biāo)蛋白氨基酸序列,和關(guān)注的同源蛋白序列進行比對,如果抗體識別的表位區(qū)域序列同源性>80%,即使說明書沒有明確標(biāo)注交叉反應(yīng),也可以預(yù)判該試劑盒大概率存在明顯的同源蛋白交叉反應(yīng)。
二、核對「物種適用性」清單,間接推導(dǎo)同源交叉反應(yīng)的覆蓋范圍
說明書中的“適用樣本類型/可檢測物種"清單,是間接判斷同源交叉反應(yīng)的重要參考。如果一個試劑盒的適用物種清單中,除了靶標(biāo)物種之外,還同時列出了近緣的多個同源物種,就說明該試劑盒的抗體可以識別這些同源物種的靶標(biāo)蛋白,本質(zhì)上就是存在跨物種同源蛋白的交叉反應(yīng)。
比如一個標(biāo)注“可檢測人、小鼠、大鼠、兔源靶蛋白"的ELISA試劑盒,就說明該試劑盒的抗體識別的是不同物種間高度保守的同源序列區(qū)域,那么它和其他親緣關(guān)系更近的同源蛋白發(fā)生交叉反應(yīng)的概率,會遠(yuǎn)高于僅單一適用于兔源樣本的試劑盒。如果說明書的適用物種清單中,沒有列出任何近緣同源物種,僅標(biāo)注單一靶標(biāo)物種,就說明該試劑盒的抗體針對靶標(biāo)物種的表位開發(fā),同源蛋白交叉反應(yīng)的風(fēng)險會更低。
三、優(yōu)先鎖定說明書中「交叉反應(yīng)性」專屬章節(jié),獲取明確標(biāo)注信息
絕大多數(shù)合規(guī)的ELISA試劑盒,都會在說明書的性能指標(biāo)板塊單獨設(shè)置“Cross Reactivity"(交叉反應(yīng)性)專屬章節(jié),這是最直接的說明依據(jù)。需要逐字核對該章節(jié)的全部內(nèi)容,確認(rèn)試劑盒明確標(biāo)注的所有可識別物種靶標(biāo)蛋白、以及明確說明無交叉反應(yīng)的同源蛋白清單。
重點關(guān)注標(biāo)注的交叉反應(yīng)率數(shù)值:行業(yè)通用標(biāo)準(zhǔn)中,交叉反應(yīng)率<0.1%代表幾乎無交叉反應(yīng),0.1%~5%屬于低水平交叉反應(yīng),>5%則屬于明顯交叉反應(yīng)。如果說明書中明確標(biāo)注“與XX物種的同源靶蛋白交叉反應(yīng)率<0.5%",就代表該試劑盒對該同源蛋白的非特異性結(jié)合極低,幾乎不會對兔源樣本的靶標(biāo)檢測產(chǎn)生明顯干擾;如果標(biāo)注的交叉反應(yīng)率>10%,則說明該試劑盒無法區(qū)分靶標(biāo)蛋白和該同源蛋白,檢測結(jié)果會出現(xiàn)嚴(yán)重的假陽性偏高偏差。
同時要特別留意該章節(jié)的備注小字部分,很多試劑盒會在角落補充說明“與同家族同源蛋白無顯著交叉反應(yīng)"的限定條件,比如部分細(xì)胞因子試劑盒會明確標(biāo)注“與IL-1家族其余同源成員交叉反應(yīng)率均<0.2%",這類細(xì)節(jié)信息是評估同源交叉反應(yīng)的關(guān)鍵補充依據(jù)。
四、通過「特異性驗證數(shù)據(jù)」細(xì)節(jié),確認(rèn)同源交叉反應(yīng)的實際驗證情況
很多嚴(yán)謹(jǐn)?shù)脑噭┖袕S商,會在說明書的特異性驗證部分,附上詳細(xì)的同源蛋白實測數(shù)據(jù),這是比文字描述更有說服力的依據(jù)。需要重點查看這部分的實驗細(xì)節(jié):廠商是否使用了高濃度(通常是靶標(biāo)檢測上限濃度的100倍以上)的同源蛋白進行了干擾實驗,實測得到的信號值是否遠(yuǎn)低于靶標(biāo)蛋白的zuidi檢出限。
如果說明書中明確給出了實測數(shù)據(jù):“加入100ng/mL的同源蛋白后,檢測信號值<0.05,與空白孔無顯著差異",就代表該試劑盒經(jīng)過了嚴(yán)格的同源交叉反應(yīng)驗證,性能可靠;如果說明書僅用“無明顯交叉反應(yīng)"這類模糊文字描述,沒有附上任何實測驗證數(shù)據(jù),就說明該試劑盒很可能沒有完成系統(tǒng)的同源交叉反應(yīng)驗證,實際使用中出現(xiàn)同源蛋白交叉反應(yīng)的風(fēng)險會大幅升高。
五、結(jié)合「回收率/抗干擾」指標(biāo),反向驗證同源交叉反應(yīng)的耐受能力
說明書中給出的高基質(zhì)樣本回收率數(shù)據(jù),也可以反向輔助判斷試劑盒對同源蛋白的抗干擾能力。如果說明書標(biāo)注的復(fù)雜基質(zhì)樣本加標(biāo)回收率穩(wěn)定在90%~110%之間,批內(nèi)CV值<10%,就說明該試劑盒的抗同源蛋白干擾能力很強,即使樣本中存在少量同源蛋白,也不會對最終檢測結(jié)果產(chǎn)生明顯影響;如果回收率波動范圍超過70%~130%,就說明試劑盒的抗干擾能力很差,樣本中微量的同源蛋白就會引發(fā)明顯的交叉反應(yīng)干擾。
這套完整的說明書排查方法,適配日常兔ELISA實驗的試劑盒選型需求,可以精準(zhǔn)識別試劑盒的同源蛋白交叉反應(yīng)風(fēng)險,從源頭上規(guī)避后續(xù)實驗出現(xiàn)假陽性、結(jié)果失真的問題。
請輸入賬號
請輸入密碼
請輸驗證碼
以上信息由企業(yè)自行提供,信息內(nèi)容的真實性、準(zhǔn)確性和合法性由相關(guān)企業(yè)負(fù)責(zé),儀表網(wǎng)對此不承擔(dān)任何保證責(zé)任。
溫馨提示:為規(guī)避購買風(fēng)險,建議您在購買產(chǎn)品前務(wù)必確認(rèn)供應(yīng)商資質(zhì)及產(chǎn)品質(zhì)量。