PCR擴(kuò)增儀的種類總體來說，可以分成兩大類，即普通PCR擴(kuò)增儀和實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增儀。

一、普通PCR擴(kuò)增儀

1）.普通PCR擴(kuò)增儀即通常所謂的定性PCR擴(kuò)增儀。
2）.梯度PCR儀是由普通PCR儀衍生出的帶梯度PCR功能的基因擴(kuò)增儀。
3）.原位PCR儀是由普通PCR儀衍生出的帶原位擴(kuò)增功能的基因擴(kuò)增儀。
 二、實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增儀
1）.金屬板式實(shí)時(shí)定量PCR儀，還可作為普通PCR儀使用，有的甚至帶梯度功能，可容納的樣本量大，無需特殊耗材，但溫度均一性欠佳，有邊緣效應(yīng)，標(biāo)準(zhǔn)曲線的反應(yīng)條件難以做到與樣品全一致。
2）.離心式實(shí)時(shí)定量PCR儀的PCR擴(kuò)增樣品槽被設(shè)計(jì)為離心轉(zhuǎn)子，溫度均一性好，但可容納樣品量少，有的需用特殊毛細(xì)管作樣品管，增加了使用成本，也不帶梯度功能。
3）.各孔獨(dú)立控溫的定量PCR儀的不同樣品槽分別擁有獨(dú)立的智能升降溫模塊，各孔獨(dú)立控溫，適合多指標(biāo)快速檢測，可實(shí)現(xiàn)任意梯度反應(yīng)，但上樣不如傳統(tǒng)方法方便，而且需要獨(dú)te的扁平反應(yīng)管，使用成本較高。