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文獻(xiàn)題目:Salt-stress-induced tomato sweetening involves an SlSnRK2.6-SlZHD8 sugar accumulation cascade triggered by root-derived abscisic acid
發(fā)表期刊:THE EMBO JOURNAL
影響因子:8.3
物種:番茄
發(fā)表時(shí)間:2026年2月2日
發(fā)表單位:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
藍(lán)景科信提供:DAP-seq技術(shù)服務(wù)
主要研究結(jié)果
“順境出產(chǎn)量,逆境促品質(zhì)”,這句古老農(nóng)諺在番茄種植中早已被驗(yàn)證——適度鹽堿環(huán)境種出的番茄,甜度更高、風(fēng)味更濃。但背后的科學(xué)機(jī)制,長(zhǎng)期以來(lái)是未解之謎。
為解析鹽脅迫提升番茄果實(shí)糖含量的分子機(jī)制,本研究通過(guò)同位素示蹤與嫁接實(shí)驗(yàn)證實(shí),根系來(lái)源的ABA是介導(dǎo)鹽脅迫誘導(dǎo)果實(shí)糖積累的核心信號(hào)。進(jìn)一步基因功能驗(yàn)證表明,SlSnRK2.6激酶作為ABA通路下游關(guān)鍵組分,直接調(diào)控鹽脅迫下的果實(shí)糖積累。酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)確認(rèn),SlZHD8是SlSnRK2.6的直接互作蛋白,且對(duì)鹽脅迫誘導(dǎo)的糖積累起負(fù)調(diào)控作用。在此基礎(chǔ)上,磷酸化實(shí)驗(yàn)證明,鹽脅迫下根系來(lái)源的ABA可促進(jìn)SlSnRK2.6對(duì)SlZHD8的磷酸化修飾,該修飾顯著降低SlZHD8的蛋白穩(wěn)定性;遺傳與表型分析進(jìn)一步證實(shí),完整的SlSnRK2.6-SlZHD8信號(hào)模塊是鹽脅迫下番茄果實(shí)糖積累的必需調(diào)控單元。
研究通過(guò)DAP-seq鑒定SlZHD8在全基因組范圍內(nèi)結(jié)合位點(diǎn),兩個(gè)重復(fù)共獲得95,682個(gè)可信重疊峰,其中16.9%的峰位于啟動(dòng)子區(qū),且在TSS上游約300bp的近端啟動(dòng)子區(qū)高度富集,其核心結(jié)合基序?yàn)門(mén)AATTAAT。GO與KEGG富集分析顯示,這些靶基因顯著富集于淀粉與蔗糖代謝、蔗糖響應(yīng)、水解酶活性及液泡膜定位等糖代謝相關(guān)過(guò)程。通過(guò)DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析,篩選出SlSUS3(蔗糖水解)和SlSWEET12(糖轉(zhuǎn)運(yùn))為SlZHD8調(diào)控果實(shí)糖積累的關(guān)鍵靶基因。后續(xù)經(jīng)EMSA、ChIP-qPCR、雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)證實(shí),SlZHD8可直接結(jié)合二者啟動(dòng)子并發(fā)揮轉(zhuǎn)錄抑制作用,而SlSnRK2.6在T247位點(diǎn)磷酸化SlZHD8可解除該抑制,進(jìn)而促進(jìn)果實(shí)糖積累。此外,SlSnRK2.6-SlZHD8-SlSWEET12模塊可同步調(diào)控根系糖分分配與Na+/K+穩(wěn)態(tài),參與番茄植株耐鹽性調(diào)控。群體遺傳分析表明,ZHD8在番茄馴化過(guò)程中受到人工選擇,并從中鑒定出能同時(shí)提升果實(shí)糖含量與耐鹽性的優(yōu)異天然單倍型。
本研究系統(tǒng)闡明了鹽脅迫下根系信號(hào)調(diào)控果實(shí)增甜的分子機(jī)制,為逆境促品質(zhì)這一重要農(nóng)業(yè)現(xiàn)象提供了核心理論支撐,并為番茄品質(zhì)與抗逆協(xié)同改良提供了關(guān)鍵基因資源與育種靶點(diǎn)。

圖1. ABA含量升高介導(dǎo)鹽脅迫下番茄果實(shí)的糖分積累。(A–G)鹽脅迫對(duì)(A)果實(shí)表型、(B)單果重、(C)成熟時(shí)間、(D)可溶性固形物含量、(E)葡萄糖含量、(F)果糖含量及(G)ABA含量的影響。(H–L)內(nèi)源ABA與鹽脅迫的互作對(duì)(H)ABA含量、(I)單果重、(J)可溶性固形物含量、(K)葡萄糖含量及(L)果糖含量的影響。

圖2. 根系來(lái)源的ABA激活SlSnRK2.6激酶,介導(dǎo)鹽脅迫下番茄果實(shí)的糖分積累。(A)鹽脅迫對(duì)ABA從根/葉向果實(shí)運(yùn)輸?shù)挠绊?。(B)對(duì)照和鹽脅迫條件下,野生型嫁接植株(WT/WT)與未嫁接植株(WT/not)的ABA含量。(C–F)根系來(lái)源ABA與鹽脅迫的互作對(duì)(C)可溶性固形物含量、(D)葡萄糖含量、(E)果糖含量及(F)SlSnRK2.6激酶活性的影響。(G–J)SlSnRK2.6與鹽脅迫的互作對(duì)(G)單果重、(H)可溶性固形物含量、(I)葡萄糖含量及(J)果糖含量的影響。

圖3. SlSnRK2.6與SlZHD8相互作用并使其磷酸化,進(jìn)而介導(dǎo)鹽脅迫下番茄果實(shí)的糖分積累。(A)SlZHD8的亞細(xì)胞定位。(B)酵母雙雜交(Y2H)實(shí)驗(yàn)表明SlSnRK2.6與SlZHD8相互作用。(C)Pull-down實(shí)驗(yàn)表明SlSnRK2.6與SlZHD8相互作用。(D)免疫共沉淀(Co-IP)實(shí)驗(yàn)表明SlSnRK2.6與SlZHD8相互作用。(E)雙分子熒光互補(bǔ)(BiFC)實(shí)驗(yàn)表明SlSnRK2.6與SlZHD8相互作用。(F)熒光素酶互補(bǔ)成像(LCI)實(shí)驗(yàn)表明SlSnRK2.6與SlZHD8相互作用。(G)SlSnRK2.6在體外磷酸化SlZHD8的T247位點(diǎn)。(H)SlSnRK2.6在體內(nèi)磷酸化SlZHD8的T247位點(diǎn)。(I)鹽脅迫下根系來(lái)源的ABA參與SlZHD8的體內(nèi)磷酸化。(J)鹽脅迫下SlSnRK2.6參與SlZHD8的體內(nèi)磷酸化。(K)無(wú)細(xì)胞降解實(shí)驗(yàn)表明SlZHD8發(fā)生依賴(lài)于SlSnRK2.6的降解。(L)體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表明SlZHD8發(fā)生依賴(lài)于SlSnRK2.6的降解。(M–P)SlSnRK2.6-SlZHD8模塊對(duì)鹽脅迫下果實(shí)糖分積累至關(guān)重要。(M)單果重、(N)可溶性固形物含量、(O)葡萄糖含量、(P)果糖含量。

圖4. SlSnRK2.6介導(dǎo)的SlZHD8磷酸化解除其對(duì)SlSUS3和SlSWEET12的轉(zhuǎn)錄抑制。(A)韋恩圖展示DAP-seq鑒定得到的結(jié)合峰。(B)SlZHD8結(jié)合峰在番茄基因組上的分布。(C)啟動(dòng)子區(qū)域富集的SlZHD8結(jié)合基序。(D)啟動(dòng)子區(qū)域SlZHD8結(jié)合峰的KEGG富集分析。(E)韋恩圖展示RNA-seq與DAP-seq的重疊基因情況。(F、G)對(duì)照與鹽脅迫條件下,SlSUS3和在野生型及slzhd8突變體果實(shí)中的表達(dá)模式。(H)SlSUS3和SlSWEET12啟動(dòng)子上的SlZHD8結(jié)合基序。(I)EMSA實(shí)驗(yàn)證實(shí)SlZHD8可直接結(jié)合SlSUS3和SlSWEET12啟動(dòng)子探針。(J)EMSA實(shí)驗(yàn)顯示,SlSnRK2.6對(duì)SlZHD8的磷酸化降低其DNA結(jié)合能力。(K)ChIP實(shí)驗(yàn)顯示,SlSnRK2.6對(duì)SlZHD8的磷酸化降低其DNA結(jié)合能力。(L)轉(zhuǎn)錄激活實(shí)驗(yàn)顯示,SlSnRK2.6對(duì)SlZHD8的磷酸化解除其轉(zhuǎn)錄抑制作用。(M)SlSnRK2.6對(duì)SlZHD8的磷酸化解除其對(duì)SlSUS3和SlSWEET12的轉(zhuǎn)錄抑制。

圖5. SlZHD8-SlSUS3/SlSWEET12模塊參與鹽脅迫下番茄果實(shí)糖分積累與脅迫耐受性。(A–C)SlZHD8-SlSUS3模塊對(duì)鹽脅迫下果實(shí)糖分積累至關(guān)重要。(A)可溶性固形物含量;(B)葡萄糖含量;(C)果糖含量。(D–F)SlZHD8-SlSWEET12模塊對(duì)鹽脅迫下果實(shí)糖分積累至關(guān)重要。(D)可溶性固形物含量;(E)葡萄糖含量;(F)果糖含量。(G–K)SlZHD8-SlSWEET12模塊參與鹽脅迫耐受性調(diào)控。(G)鹽脅迫下幼苗及根系表型;(H)植株干重;(I)根冠比;(J)根系可溶性糖含量;(K)根系Na+/K+比值。

圖6. ZHD8的自然變異與果實(shí)糖分積累及耐鹽性相關(guān)。(A)ZHD8位于番茄馴化選擇區(qū)間內(nèi),但未達(dá)到改良選擇區(qū)間的閾值。(B)基于631份番茄種質(zhì)(包括野生醋栗番茄SP、櫻桃番茄SLC、栽培番茄SLL,含傳統(tǒng)品種與現(xiàn)代品種)的ZHD8單倍型聚類(lèi)分析。(C)EMSA實(shí)驗(yàn)顯示ZHD8HapB單倍型DNA結(jié)合能力降低。(D)ChIP實(shí)驗(yàn)顯示ZHD8HapB單倍型DNA結(jié)合能力降低(E)ZHD8單倍型在SP、SLC、SLL(傳統(tǒng)品種與現(xiàn)代品種)群體中的頻率分布,標(biāo)注各組中HapA與HapB的數(shù)量。(F)ZHD8HapA與ZHD8HapB的地理分布。(G–J)ZHD8HapB單倍型在鹽脅迫下增強(qiáng)果實(shí)糖分積累。(G)單果重;(H)可溶性固形物含量;(I)葡萄糖含量;(J)果糖含量。(K–O)ZHD8HapB單倍型增強(qiáng)植株耐鹽性。(K)鹽脅迫下幼苗及根系表型;(L)植株干重;(M)根冠比;(N)根系可溶性糖含量;(O)根系Na+/K+比值。

圖7. 機(jī)制模式圖。在鹽脅迫條件下,根部產(chǎn)生的脫落酸(ABA)向果實(shí)的運(yùn)輸量增加。果實(shí)中升高的ABA會(huì)激活SlSnRK2.6激酶,該激酶通過(guò)磷酸化SlZHD8并降低其蛋白質(zhì)穩(wěn)定性及DNA結(jié)合能力,從而抑制SlZHD8的功能;這一過(guò)程解除了SlZHD8對(duì)SlSUS3和SlSWEET12的抑制作用,進(jìn)而促進(jìn)果實(shí)糖分積累。與此同時(shí),SlSnRK2.6-SlZHD8-SlSWEET12調(diào)控模塊還參與調(diào)節(jié)根部糖分積累并賦予植物鹽脅迫耐受性。進(jìn)化分析鑒定出一種優(yōu)異單倍型ZHD8HapB,因其啟動(dòng)子結(jié)合親和力降低,可在提升果實(shí)糖分的同時(shí)增強(qiáng)耐鹽性。

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