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可采用哪些處理方法緩解豬血清與血漿樣本所產(chǎn)生的基質(zhì)干擾效應(yīng)?

來(lái)源:上海撫生實(shí)業(yè)有限公司   2026年06月24日 10:17  

豬血清、血漿樣本中的基質(zhì)干擾會(huì)直接抑制聚合酶活性、降低擴(kuò)增效率,尤其影響低豐度靶標(biāo)的檢測(cè)靈敏度,可通過(guò)以下多維度方案系統(tǒng)性降低干擾:

一、樣本采集與前處理源頭控制

規(guī)范采集操作?:使用無(wú)熱源、無(wú)RNaseEDTA或肝素抗凝采血管,避免溶血——溶血釋放的血紅蛋白、鐵離子是強(qiáng)PCR抑制劑,會(huì)直接結(jié)合DNA聚合酶使其失活。采血后30分鐘內(nèi)43000g離心15分鐘,分離上層血漿/血清,避免反復(fù)凍融,4℃保存不超過(guò)24小時(shí),-80℃長(zhǎng)期儲(chǔ)存。

樣本稀釋預(yù)處理?:將原始血清/血漿樣本按1:5~1:10比例用無(wú)酶水稀釋?zhuān)蠓档脱t蛋白抑制物的濃度,同時(shí)保留足夠的靶標(biāo)核酸拷貝數(shù),適配巢式PCR等高靈敏度檢測(cè)體系。

二、高效核酸提取技術(shù)去除干擾

磁珠法核酸純化?:選擇針對(duì)豬血液優(yōu)化的硅基磁珠試劑盒,通過(guò)裂解液中高濃度異硫氰酸胍變性蛋白,再經(jīng)多次洗滌液(含高鹽乙醇)去除殘留的血紅素、免疫球蛋白、脂類(lèi)雜質(zhì),最終洗脫的核酸純度A260/A280比值穩(wěn)定在1.8~2.0,幾乎消除基質(zhì)干擾。

蛋白酶K深度消化?:在提取體系中加入終濃度200μg/mL的蛋白酶K,56℃孵育30~60分鐘,充分降解血清中的白蛋白、抗體等結(jié)合核酸的蛋白,釋放游離核酸的同時(shí)去除蛋白類(lèi)抑制劑。

三、PCR體系優(yōu)化增強(qiáng)抗干擾能力

添加抗干擾助劑?:在反應(yīng)體系中加入1%~2%BSA(牛血清白蛋白),其可結(jié)合血紅素、酚類(lèi)等抑制劑,避免其與聚合酶結(jié)合;同時(shí)添加5%~8%DMSO或甘油,提升聚合酶穩(wěn)定性,抵消基質(zhì)帶來(lái)的活性抑制。

選擇高耐受酶體系?:替換普通Taq酶為經(jīng)過(guò)基因工程改造的抗抑制熱啟動(dòng)Taq酶,或適配巢式PCR的高保真酶,這類(lèi)酶對(duì)血液基質(zhì)中的抑制劑耐受能力是普通酶的3~5倍,可直接處理粗提核酸樣本。

調(diào)整反應(yīng)參數(shù)?:適當(dāng)延長(zhǎng)第一輪擴(kuò)增的預(yù)變性時(shí)間至955分鐘,充分打開(kāi)核酸二級(jí)結(jié)構(gòu),同時(shí)將Mg2+濃度從常規(guī)1.5mM提升至2.0~2.5mM,抵消基質(zhì)成分對(duì)鎂離子的螯合作用,維持聚合酶活性。

四、針對(duì)性特殊場(chǎng)景優(yōu)化

針對(duì)基層豬場(chǎng)的大規(guī)模篩查場(chǎng)景,可采用“直擴(kuò)型抗干擾PCR試劑盒”,無(wú)需復(fù)雜核酸提取,僅需將血清樣本經(jīng)95℃熱裂解10分鐘后取上清直接上樣,配合預(yù)混的抗抑制緩沖液,即可完成批量檢測(cè),大幅降低操作門(mén)檻,同時(shí)保證低豐度豬瘟、非洲豬瘟等靶標(biāo)的檢出率。


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