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DAP-seq助力揭示多年生黑麥草LpMYBR1調(diào)控葉色的分子機制

來源:藍景科信河北生物科技有限公司   2026年07月23日 14:31  


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文獻題目:LpMPK6 regulates leaf color in perennial ryegrass by inhibiting LpMYBR1-modulated transcription of LpNRT1.5

發(fā)表期刊:Journal of Integrative Plant Biology

影響因子:9.3

發(fā)表時間:2026年3月12日

發(fā)表單位:西北農(nóng)林科技大學

藍景科信提供:DAP-seq技術服務

主要研究內(nèi)容

草坪草葉色是評判其觀賞價值與生長健康狀態(tài)的核心指標,氮素是構成葉綠素的關鍵元素,硝態(tài)氮的吸收、轉運過程顯著影響草坪草葉色表型,而多年生黑麥草中氮素介導葉色調(diào)控的分子機制一直未被闡明。本研究發(fā)現(xiàn),低氮/缺營養(yǎng)條件下,LpMPK6過表達株系葉片黃化加劇,葉綠素、總氮及硝態(tài)氮含量降低,RNAi株系則保持綠葉、氮素與葉綠素含量更高,證明LpMPK6負調(diào)控黑麥草葉色與氮積累。經(jīng)酵母雙雜交、Pull-down、Co-IP、熒光素酶互補等實驗證實,LpMPK6與轉錄因子LpMYBR1特異性互作,且二者功能拮抗,LpMYBR1能夠改善植株在低氮環(huán)境下的葉片持綠特性。

為挖掘LpMYBR1的下游靶基因,本研究借助DAP-seq技術開展全基因組篩選,共鑒定出90001個LpMYBR1結合峰,其中8.2%位于基因啟動子區(qū)域;同時預測得到6個MYB轉錄因子保守結合基序。對啟動子區(qū)對應的靶基因進行GO功能富集分析,顯著富集到6個氮素調(diào)控相關通路,并篩選出LpNRT1.5、LpNRT1.8等硝態(tài)氮轉運蛋白候選基因。酵母單雜交、凝膠遷移及雙熒光素酶實驗證實,LpMYBR1能夠直接結合LpNRT1.5啟動子并激活其轉錄,但對LpNRT1.8無調(diào)控作用。功能驗證表明,定位于細胞膜的LpNRT1.5特異性介導硝態(tài)氮從根系向地上部轉運,并不參與根系對硝態(tài)氮的吸收。磷酸化實驗進一步證明,LpMPK6可靶向磷酸化LpMYBR1的第18位T殘基,顯著削弱LpMYBR1的轉錄激活活性;該調(diào)控效應會抑制LpNRT1.5表達,降低硝態(tài)氮根冠轉運,最終導致葉片氮素與葉綠素合成受阻,引發(fā)葉片黃化。

該研究解析了多年生黑麥草中LpMPK6-LpMYBR1-LpNRT1.5的調(diào)控通路,優(yōu)化了葉色與氮素代謝的分子機理研究,對培育低氮適應性強、觀賞品質優(yōu)良的草坪草品種具有重要指導意義。

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圖1. LpMPK6與LpMYBR1的相互作用。(A)酵母雙雜交(Y2H)實驗顯示LpMPK6與LpMYBR1之間的相互作用。(B)熒光素酶互補成像(LCI)實驗表明LpMPK6與LpMYBR1存在相互作用。(C)下拉實驗顯示GST-LpMPK6與His-LpMYBR1的結合關系。(D)共免疫沉淀(Co-IP)實驗證實植物中LpMYBR1-GFP可與LpMPK6-Flag結合。

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圖2. LpMYBR1調(diào)控LpNRT1.5的轉錄。(A)通過DAP-seq鑒定出的LpMYBR1結合峰在全基因組范圍內(nèi)的分布。(B)推定LpMYBR1靶基因的GO富集情況。(C、D)野生型、LpMYBR1過表達株及RNAi處理幼苗中15NO3-的吸收效率(C)和根-莖轉運效率(D)。(E)野生型、LpMYBR1過表達株及RNAi處理幼苗中LpNRT1.5的轉錄水平。(F)LpNRT1.5啟動子片段示意圖。(G)LpMYBR1與截短啟動子(pLpNRT1.5T)結合的酵母單雜交實驗結果。(H)LpMYBR1與F1/F2啟動子片段結合的EMSA實驗結果。(I)雙熒光素酶實驗中使用的效應基因與報告基因構建體示意圖。(J)雙熒光素酶實驗的代表性熒光圖像。(K)LUC/REN熒光素酶活性相對值。

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