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DAP-seq助力揭示TaWRKY58介導(dǎo)小麥生長(zhǎng)及干旱脅迫應(yīng)答的分子調(diào)控機(jī)制

來(lái)源:藍(lán)景科信河北生物科技有限公司   2026年09月30日 17:10  


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文獻(xiàn)題目:The transcription factor TaWRKY58 coordinates growth and drought sensitivity in wheat by repressing TaLRR and TaBCS1

發(fā)表期刊:PLOS Genetics

影響因子:3.9

物種:小麥

發(fā)表時(shí)間:2026年4月

發(fā)表單位:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)

藍(lán)景科信提供:DAP-seq技術(shù)服務(wù)

主要研究?jī)?nèi)容

小麥?zhǔn)侨蚝诵募Z食作物,憑借其適應(yīng)性強(qiáng)、產(chǎn)量高、易儲(chǔ)存、加工用途廣泛等突出優(yōu)勢(shì)發(fā)揮著不可替代的作用。小麥生育期常面臨各類(lèi)生物與非生物脅迫,想要穩(wěn)產(chǎn)增產(chǎn),必須平衡自身生長(zhǎng)發(fā)育與逆境脅迫適應(yīng)能力。WRKY轉(zhuǎn)錄因子是調(diào)控植物生長(zhǎng)代謝與脅迫應(yīng)答的關(guān)鍵元件,廣泛參與小麥抗逆與生長(zhǎng)調(diào)控過(guò)程,目前小麥WRKY基因家族中,僅少數(shù)成員的生物學(xué)功能得到解析,絕大多數(shù)家族基因的分子調(diào)控通路與作用機(jī)制仍缺乏系統(tǒng)闡釋。。先前研究表明TaWRKY58參與小麥紫外脅迫、熱脅迫、病原菌抗性及水楊酸合成等過(guò)程,但該基因調(diào)控小麥生長(zhǎng)與抗逆平衡的分子機(jī)制及下游靶基因仍未得到系統(tǒng)解析。

本研究以小麥TaWRKY58為研究對(duì)象,通過(guò)生物信息學(xué)分析、亞細(xì)胞定位觀察及多脅迫表達(dá)模式檢測(cè),明確TaWRKY58的基因分類(lèi)特征、細(xì)胞核定位特性以及廣譜脅迫誘導(dǎo)表達(dá)規(guī)律。TILLING突變體與TaWRKY58過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因材料表型與生理鑒定結(jié)果表明TaWRKY58負(fù)調(diào)控赤霉素積累,進(jìn)而抑制小麥株高、推遲開(kāi)花;該基因僅特異性負(fù)調(diào)控小麥干旱響應(yīng)通路,對(duì)小麥赤霉病抗性、耐鹽能力無(wú)明顯調(diào)控作用。

為解析TaWRKY58全基因組調(diào)控網(wǎng)絡(luò),本研究利用DAP-seq篩選其DNA結(jié)合位點(diǎn),共得到754059個(gè)高置信結(jié)合峰,顯著富集于基因轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游1kb近端啟動(dòng)子區(qū)域;motif分析顯示TaWRKY58依賴(lài)W-box元件識(shí)別靶序列。GO富集顯示靶基因集中參與蛋白Ser/Thr激酶活性、碳水結(jié)合等通路,關(guān)聯(lián)植株信號(hào)傳導(dǎo)、能量代謝與逆境響應(yīng)進(jìn)程。qRT-PCR、EMSA與雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步鎖定TaLRR、TaBCS1為TaWRKY58下游核心靶基因且TaWRKY58可特異性結(jié)合兩個(gè)靶基因啟動(dòng)子上W-box順式元件,并顯著抑制二者的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。遺傳突變體生理試驗(yàn)證實(shí),干旱脅迫下,TaLRR、TaBCS1表達(dá)顯著上調(diào);兩個(gè)突變體均對(duì)干旱高度敏感,干旱處理后可溶性糖含量大幅下降、赤霉素含量顯著降低。TaWRKY58通過(guò)分別抑制TaLRR、TaBCS1,協(xié)同調(diào)控小麥株高與干旱敏感性。

綜上,TaWRKY58作為轉(zhuǎn)錄抑制子,形成一套完整調(diào)控模塊,通過(guò)協(xié)同調(diào)控信號(hào)通路與線(xiàn)粒體能量代謝,精細(xì)權(quán)衡小麥生長(zhǎng)發(fā)育和干旱脅迫適應(yīng)的平衡關(guān)系。本研究為定向改良小麥、培育環(huán)境波動(dòng)下產(chǎn)量穩(wěn)定、抗逆優(yōu)良的新品種提供理論基礎(chǔ)與育種策略。

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圖1.DAP-seq鑒定TaWRKY58的靶基因。(A)TaWRKY58結(jié)合峰在各基因組功能區(qū)域的分布情況。(B)TaWRKY58結(jié)合峰在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(TSS)上下游1kb區(qū)間內(nèi)的富集分布。(C)在TaWRKY58結(jié)合峰中從頭挖掘得到的顯著富集結(jié)合基序Motif1。(D)Motif1相對(duì)于結(jié)合峰中心的位置分布頻率。(E)含Motif1靶基因中富集程度的分子功能(GO分析)。

 

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圖2.TaWRKY58介導(dǎo)轉(zhuǎn)錄抑制的分子機(jī)制。(A)Z60時(shí)期野生型與Δtawrky58突變體穗軸中TaLRR、TaBCS1的相對(duì)表達(dá)量。(B)EMSABio標(biāo)記探針及競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)示意圖。(C)AlphaFold預(yù)測(cè)TaWRKY58與Motif1關(guān)鍵結(jié)合位點(diǎn)。(D)EMSA驗(yàn)證TaWRKY58結(jié)合TaLRR啟動(dòng)子。(E)EMSA檢測(cè)TaWRKY58結(jié)合TaBCS1啟動(dòng)子及4種突變探針,M1探針無(wú)結(jié)合條帶。(F)雙熒光素酶試驗(yàn)證明TaWRKY58抑制TaLRR啟動(dòng)子活性。(G)水稻原生質(zhì)體中標(biāo)準(zhǔn)化熒光素酶比值(LUC/REN),證明TaWRKY58抑制TaLRR、TaBCS1啟動(dòng)子。

藍(lán)景科信核心服務(wù)體系涵蓋DAP-seq、RNA-seq及ChIP-seq、ATAC-seq等組學(xué)技術(shù),同時(shí)配套EMSA、Dual-LUC、Y1H、ChIP-qPCR等下游驗(yàn)證方案,并提供蛋白Pull-down、Y2H、Co-IP等全套蛋白互作服務(wù)。打造“組學(xué)檢測(cè)—功能驗(yàn)證—互作分析”一站式轉(zhuǎn)錄因子研究解決方案,支撐科研工作高效推進(jìn)!

 

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