何為NGS?它面臨著哪些問題?

NGS已經(jīng)成為一個研究平臺，雖然在科學(xué)和技術(shù)領(lǐng)域迅速獲得認可，但就管理和實踐層面，仍面臨著許多障礙要跨越，包括相關(guān)規(guī)定，臨床方針(ASCO NCCN等)方面的合并，報銷，以及醫(yī)生和病人對它的認知問題。

因此，如果個性化腫瘤學(xué)的潛力被意識到，NGS技術(shù)被診所*接受，利益相關(guān)團體就必須建立一個共同承諾，zui近在山景城舉行的個性化醫(yī)療世界會議上，部分發(fā)言人提出了此觀點。

發(fā)言人之一John Leite是Illumina公司腫瘤市場開發(fā)和產(chǎn)品管理副總裁。Leite博士強調(diào)：需要同所有腫瘤團體的利益相關(guān)者達成一些共識，如什么樣的產(chǎn)品zui符合市場需求，開發(fā)這些臨床應(yīng)用產(chǎn)品所需的資料支持，以及醫(yī)生和病人的訴求等等。這些利益相關(guān)者包括監(jiān)管機構(gòu)，宣傳組，購買者和科學(xué)家。

“對許多利益相關(guān)者而言，要他們采用NGS的解決方案，就需要臨床數(shù)據(jù)來證明這些方案的價值，” Leite博士補充說。 “如果要評估病人治療結(jié)果的改變，臨床試驗將是*的臨床數(shù)據(jù)的生成機制?！?/p>

何為液體活檢?為何要選擇液體活檢?

Mark Erlander博士說：“一個成長中的腫瘤會不斷釋放壞死的細胞，噴灑它的基因物質(zhì)，它們會進入血液和尿液，因而 我們使用精密癌癥患者監(jiān)控平臺(PCM)，即利用尿液進行非侵入式的癌癥檢測，監(jiān)測式的液體活檢?！?/p>

“DNA正在極度退化中。中等長度的DNA在等離子體中約為145 - 150 bp，在尿液中約為75 – 100bp。 即便你擁有DNA樣本序列是支離破碎的也沒有關(guān)系，只要它還存在，就可以通過NGS進行檢測。 我們的突變等位基因濃縮技術(shù)可抑制野生型等位基因的放大，從而致使突變序列擴增，把絕大多數(shù)的野生型基因變成*的突變序列?！?/p>

驅(qū)動突變可預(yù)測患者是否會對特定的治療做出反應(yīng)。Erlander博士提到：“我們關(guān)注疾病的第四階段的，因為這階段是分子靶向藥物進行大規(guī)模人群實驗，這也是對病人而言zui可怕的事情。 ”變異監(jiān)測可以確定病人實際的反應(yīng)。

在在一個前瞻性雙盲實驗中，PCM從組織細胞疾病患者身上探測到了BRAFV600E突變，收集到的數(shù)據(jù)包括測對BRAF抑制劑和抗治療突變的反應(yīng)。當(dāng)細胞組織切片的腫瘤含量低并含有高基質(zhì)污染的時候，通常檢測較為困難，此時液體活檢的潛力也就凸顯出來了。

為什么ctDNA如此火熱?

Erlander博士認為，循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)成為長期研究的熱點有兩個關(guān)鍵原因：一是ctDNA可以通過非侵入性測試被檢測。 二是癌癥的復(fù)雜多變性，癌癥細胞會不斷增殖克隆，但有一個問題，當(dāng)血液尿液提供的掃描影響顯示癌癥患者已經(jīng)開始擴散的時候，你會選擇哪一種活檢?

Erlander博士還表示：“zui近，Illumina公司的解決方案被應(yīng)用于腫瘤學(xué)ctDNA分析領(lǐng)域，十分令人興奮。循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)，除了可以作為分子標志物以外，重復(fù)進行ctDNA試驗還可以用于檢測治療效果，闡明耐藥性產(chǎn)生的機制，確定進一步治療方案。循環(huán)腫瘤DNA為診斷試驗提供了可靠的材料，從而彌補了組織缺少的不足。ctDNA分析的敏感性和度很高，足以進行腫瘤負荷的監(jiān)測，包括微小殘留病灶和抵抗性產(chǎn)生機制的鑒定，監(jiān)測新生的疾病和新抗治療突變?！?/p>

賽默飛世爾腫瘤學(xué)業(yè)務(wù)副總裁、總Mike Nolan表示，他們的公司負責(zé)分銷Cynvenio Biosystems公司的用于血流中腫瘤標志物基因組分析的液態(tài)切片(LiquidBiopsy)。他認為賽默飛的Ion Torrent測序平臺可補充PGM工作流程，僅用一小管血液便可分析游離DNA和血液循環(huán)腫瘤細胞，從而為客戶提供一個基因組樣品數(shù)據(jù)的解決方案。

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