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New Phytologist(IF=8.1)|DAP-seq助力解析擬南芥雄性育性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

來源:藍(lán)景科信河北生物科技有限公司   2025年09月24日 17:37  

2025年7月6日,浙江大學(xué)徐娟教授團隊在New Phytologist期刊發(fā)表了一篇題為“A DELLA-ANAC106 reciprocal negative feedback circuit modulates gibberellin homeostasis to regulate male fertility in Arabidopsis”研究論文。該研究借助DAP-seq技術(shù)揭示了擬南芥中DELLA-ANAC106雙向負(fù)反饋回路調(diào)控赤霉素(GA)穩(wěn)態(tài)以維持雄性育性的分子機制,為植物生殖過程中植物激素調(diào)控提供新范式,也為作物遺傳改良提供了重要的理論基礎(chǔ)和潛在靶點。

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文章主要內(nèi)容

New Phytologist(IF=8.1)|DAP-seq助力解析擬南芥雄性育性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

研究背景

花粉形成是開花植物繁殖的關(guān)鍵,其發(fā)育與花藥絨氈層(最內(nèi)層細(xì)胞)的精準(zhǔn)調(diào)控緊密相關(guān)。絨氈層需通過程序性細(xì)胞死亡(PCD)為花粉提供營養(yǎng),提前或延遲降解均會致花粉敗育。赤霉素(GA)的劑量與合成位置對花粉發(fā)育至關(guān)重要:GA缺陷突變體(如ga1-3)花粉發(fā)育停滯,過量GA也會引發(fā)雄性不育,足見GA穩(wěn)態(tài)是育性核心調(diào)控因素。

GA通過結(jié)合受體GID1降解DELLA抑制蛋白激活信號,擬南芥中DELLA蛋白(如RGA、GAI)是花藥發(fā)育關(guān)鍵抑制因子,其突變會致不育。雖GA代謝通路已明晰,但花粉發(fā)育中GA水平調(diào)控的分子機制仍不明,且NAC轉(zhuǎn)錄因子家族在該過程中的作用未知。

研究結(jié)果

研究發(fā)現(xiàn)AT3G12910受MPK3/MPK6激活上調(diào),經(jīng)鑒定為新NAC轉(zhuǎn)錄因子ANAC106。為研究其功能,作者構(gòu)建了ANAC106過表達株系(OE),發(fā)現(xiàn)高表達株系嚴(yán)重矮化無花序,中等表達株系表現(xiàn)為雄性不育,無法形成可育角果。亞歷山大染色顯示,OE株系花藥無可育花粉;野生型花粉授粉可使OE株系結(jié)籽,表明其雌性器官功能正常。GUS染色顯示,ANAC106在幼嫩花藥中高表達,表明其在雄性生殖過程中的特異性作用。作者進一步構(gòu)建了ANAC106-EAR顯性負(fù)性株系,發(fā)現(xiàn)EAR株系與OE株系表型相似,均表現(xiàn)為雄性不育,花藥成熟花粉極少;且自身啟動子驅(qū)動的該株系也不育。綜上表明,ANAC106過表達與抑制的正常功能與均會導(dǎo)致擬南芥雄性不育。

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圖1. 過量表達ANAC106導(dǎo)致擬南芥雄性嚴(yán)重不育

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圖2. 顯性負(fù)調(diào)控ANAC106同樣會導(dǎo)致擬南芥雄性不育

為探究OE和EAR株系雄性不育機制,作者觀察不同發(fā)育階段花藥半薄切片,發(fā)現(xiàn)與野生型相比,EAR株系花藥第9-10階段絨氈層降解延遲,第9階段絨氈層肥大、小孢子降解,第12階段花粉敗育;OE花藥絨氈層發(fā)育不良且降解提前,第9階段無完整絨氈層,第10階段降解,第11階段花粉敗育。相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平檢測顯示,DYT1、MYB35(TDF1)等絨氈層發(fā)育基因,在OE和EAR花序中表達均較低;絨氈層降解相關(guān)的CEP1、PASPA3基因在OE中表達顯著高于野生型,EAR中CEP1表達降低。綜上表明,ANAC106是花藥絨氈層細(xì)胞程序性降解的重要正調(diào)控因子。

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圖3. 過表達和顯性負(fù)抑制對ANAC106在擬南芥花粉中的發(fā)育具有相反的影響

為鑒定ANAC106在調(diào)控絨氈層降解中的直接靶基因,通過DAP-seq鑒定出10665個潛在結(jié)合位點,核心序列為“MRRYGSCGTNDHNDHNMCGBHRH”,該CGT(7n)MCG基序與已知NAC成員保守,且發(fā)現(xiàn)ANAC106結(jié)合GA3ox2啟動子與GA3ox4第1外顯子。GO富集分析顯示赤霉素代謝基因富集。同時作者構(gòu)建了DEX誘導(dǎo)型株系,發(fā)現(xiàn)DEX處理致花發(fā)育缺陷及雄性不育。RNA-seqGO富集分析顯示,均富集赤霉素生物合成過程調(diào)控,且僅赤霉素處理上調(diào)ANAC106表達。EMSA、qPCR和雙熒光素酶實驗進一步證實了ANAC106結(jié)合并激活GA3ox2/4表達。此外,還發(fā)現(xiàn)ANAC106還靶向GA2ox1。綜上表明,ANAC106可能通過靶向赤霉素合成與失活基因調(diào)控活性赤霉素平衡。

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圖4. ANAC106直接調(diào)控擬南芥赤霉烯(GA)代謝相關(guān)基因表達

為驗證ANAC106對活性赤霉素(GA)水平的調(diào)控作用,作者通過UHPLC-MS/MS檢測相關(guān)轉(zhuǎn)基因株系,結(jié)果顯示經(jīng)DEX處理的OE株系活性GA含量顯著升高,EAR株系GA水平略低或與野生型持平,表明ANAC106雙向調(diào)控GA合成與失活。Westernblot結(jié)果顯示,OE株系中DELLA蛋白(RGA、GAI)豐度顯著降低,EAR株系中DELLA蛋白積累;DEX誘導(dǎo)ANAC106表達可促進RGA/GAI降解,且蛋白酶體抑制劑MG132能抑制該過程,表明ANAC106通過GA依賴的泛素-蛋白酶體途徑降解DELLA。作者進一步構(gòu)建MYC-GAI轉(zhuǎn)基因株系并與GVG:ANAC106雜交,發(fā)現(xiàn)DEX處理的雙轉(zhuǎn)基因株系MYC-GAI水平降約50%,且降解同樣依賴泛素-蛋白酶體途徑。此外,OE株系不育表型與rga/gai雙突變體相似,OE花序中RGA豐度降低、EAR株系中升高,進一步表明DELLA蛋白參與ANAC106調(diào)控的花粉發(fā)育。

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圖5. ANAC106正向調(diào)控擬南芥中生物活性赤霉素(GAs)的水平,并負(fù)向影響DELLA蛋白的豐度

為進一步探究ANAC106與DELLA蛋白的關(guān)系,作者構(gòu)建了兩個RGA-eYFP轉(zhuǎn)基因株系(分別由絨氈層特異性LTP12啟動子和花粉特異性LAT52啟動子驅(qū)動),并與ANAC106-OE株系雜交獲得雙轉(zhuǎn)基因株系。結(jié)果顯示,兩種雙轉(zhuǎn)基因株系的不育表型均顯著恢復(fù):可產(chǎn)生可育角果。亞歷山大染色顯示花粉活力大幅提升,半薄切片顯示絨氈層提前降解缺陷得到改善。以上結(jié)果表明,在ANAC106調(diào)控的花粉發(fā)育基因網(wǎng)絡(luò)中,DELLA蛋白在下游發(fā)揮重要作用。

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圖6. ANAC106通過赤霉素(GA)-DELLA通路調(diào)控擬南芥雄性生殖力

酵母雙雜交(Y2H)實驗結(jié)果顯示,擬南芥5種DELLA蛋白中,除RGL1外,其余4種均能與ANAC106相互作用。免疫共沉淀(Co-IP)結(jié)果進一步證實,RGA和GAI在體內(nèi)可與ANAC106蛋白相互作用。進一步分析發(fā)現(xiàn),RGA和GAI均與ANAC106的N端區(qū)域(含DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域)相互作用,而不與C端相互作用。隨后,作者在擬南芥葉肉原生質(zhì)體中進行了瞬時表達實驗。結(jié)果顯示,ANAC106可激活GA3ox2、GA3ox4的熒光素酶活性,而RGA或GAI可劑量依賴地抑制該活性。綜上表明,DELLA蛋白與ANAC106的相互作用以劑量依賴方式抑制ANAC106的轉(zhuǎn)錄活性。

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圖7. DELLA蛋白抑制ANAC106的轉(zhuǎn)錄活性

本研究揭示擬南芥中DELLA-ANAC106雙向負(fù)反饋回路調(diào)控赤霉素(GA)穩(wěn)態(tài)、維持雄性育性的機制:新發(fā)現(xiàn)的NAC轉(zhuǎn)錄因子ANAC106可激活GA合成基因(GA3ox2、GA3ox4)以提升活性GA水平,促進DELLA蛋白降解;而DELLA蛋白(如RGA、GAI)則以劑量依賴方式與ANAC106互作,抑制其轉(zhuǎn)錄活性,避免GA過量。ANAC106過表達(功能獲得)致絨氈層提前降解,顯性負(fù)抑制(功能缺失)致其延遲降解,二者均引發(fā)雄性不育。該回路通過自我校正實現(xiàn)花藥GA時空精準(zhǔn)調(diào)控,為植物生殖激素調(diào)控提供新范式。

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圖8. DELLA-ANAC106反饋回路調(diào)控擬南芥花粉發(fā)育的功能模型




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