文獻題目:The transcription factor BnaA9.NST3 promotes flowering via the photoperiod pathway in Brassica napus L.
發(fā)表期刊:Plant Physiology
影響因子:8.2
物種:甘藍型油菜
發(fā)表時間:2025年5月23日
發(fā)表單位:西南大學
藍景科信提供:DAP-seq技術服務
主要研究結果
甘藍型油菜是重要的油料作物之一,生育期跨度大、種植區(qū)域廣,可通過調整開花時間適應不同地理環(huán)境。開花期是與油菜產量密切相關的核心性狀。因此,解析油菜開花時間的遺傳調控機制、明確其環(huán)境適應性機理,具備重要生產應用價值。此前已有研究表明,植物次生壁合成與開花進程存在關聯。生殖生長啟動的典型特征之一就是植株次生生長增強,開花會觸發(fā)莖稈木質部擴張,但目前開花轉變過程中地上部發(fā)育重塑與次生生長耦聯的分子遺傳機制尚不明確。
本研究鑒定出NAC家族轉錄因子BnaA9.NST3(次生壁增厚調控因子3),該蛋白是調控甘藍型油菜木質部纖維細胞次生壁合成的關鍵因子。研究通過DAP-seq結合RNA-seq分析發(fā)現,BnaA9.NST3能夠直接結合并激活光周期通路核心基因BnaC8.NF-YC9、BnaA10.CO及BnaC9.CO的啟動子。酵母雙雜交、酵母三雜交與免疫共沉淀實驗進一步證明,BnaC8.NF-YC9可與Bna.CO蛋白相互作用形成NF-CO復合物,通過調控開花素基因Bna.FT的表達,最終介導油菜開花進程?;蚬δ茯炞C實驗表明,沉默BnaC8.NF-YC9僅能部分恢復BnaA9.NST3過表達株系的早花表型,證明BnaA9.NST3還可通過不依賴NF-CO復合物的通路調控開花。晝夜節(jié)律表達分析顯示,長日照環(huán)境下,BnaA9.NST3過表達可顯著上調BnaA10.CO的表達,而敲除BnaA9.NST3并未造成BnaA10.CO表達明顯下降,推測油菜基因組中存在基因功能冗余現象。此外,本研究還證實開花素可反向誘導BnaA9.NST3表達,二者形成正向反饋調控環(huán)路,協同調控甘藍型油菜的開花發(fā)育與莖稈次生壁生物合成。
本研究在油菜中揭示了開花與次生生長的協同調控網絡,豐富了開花調控的分子機理,也為培育花期適宜的甘藍型油菜品種提供了候選基因靶點。
圖1. 鑒定BnaC8.NF-YC9為BnaA9.NST3的下游靶基因。(A)基于DAP-Seq結果,對BnaA9.NST3的靶基因進行GO富集分析。(B)左上方韋恩圖展示:相較于野生型,過表達株系上調基因、敲除株系下調基因中共同包含的92個開花相關基因。(C)利用IGV展示BnaA9.NST3在BnaC8.NF-YC9啟動子上的結合峰。(D)通過DAP-seq鑒定得到的BnaA9.NST3 DNA結合基序。(E)酵母單雜交(Y1H)實驗證明 BnaA9.NST3 可結合BnaC8.NF-YC9啟動子。(F)凝膠遷移實驗(EMSA)證實 BnaA9.NST3 能夠結合BnaC8.NF-YC9啟動子上的預測結合基序。(G)BnaA9.NST3 可激活BnaC8.NF-YC9的表達。
圖2. BnaA9.NST3直接靶向Bna.CO。(A)利用IGV展示BnaA9.NST3與靶基因BnaA10.CO、BnaC9.CO的結合情況。(B)酵母單雜交(Y1H)結果證實,BnaA9.NST3可結合BnaA10.CO與BnaC9.CO的啟動子。(C)BnaA9.NST3能夠激活BnaA10.CO和BnaC9.CO的表達。(D)長日照周期內,野生型株系、過表達株系(OE#8、OE#10)及敲除株系(KO#1、KO#3)中BnaA10.CO*的表達動態(tài)。

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